0% Complete
صفحه اصلی
/
چهارمین کنفرانس بین المللی محاسبات نرم
کشف ارتباط اسنیپ-بیماری در داده های ژنوم سراسری
نویسندگان :
فریبا اسمعیلی
1
زهرا نریمانی
2
مهدی وثیقی
3
1- دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان
2- دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان
3- دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان
کلمات کلیدی :
پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی، داده های ژنی، الگوریتم جستوجوی هارمونی
چکیده :
عامل اصلی در ایجاد بيماري های دارای منشأ ژنتیکی، در مطالعه ی توالی DNA قابل شناسایی است. با پیشرفت علم ژنتیک دانشمندان به تأثیر همزمان و هم افزای ژن ها در ایجاد صفات (و همچنین بیماری های) چندژنی پی بردند. کشف انواع ارتباط و هم افزایی ژن ها یا بطور کلی نواحی خاص روی DNA، که زمینه ساز بیماری هایی مانند آلزایمر هستند، یک مسأله چالش برانگیز است. شایع ترین نوع تغییرات ژنتیکی، پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (اسنیپ) است. چند شکلی های تک نوکلئوتیدی، تفاوت یافت شده دریک نوکلئوتید نسبت به موقعیت مشابه آن در توالی DNA است و زمانی ایجاد می شود که یک نوکلئوتید تکی در دنباله DNA جایگزین شود. در حیطه مطالعه ی داده های ژنی باابعاد بالا، یک چالش اساسی تشخیص انواع اسنیپ هایی است که در بروز یک بیماری به صورت غیرخطی باهم ارتباط دارند و باعث ایجاد بیماری می شوند. در حال حاضر روش های گوناگونی برای کشف فعل و انفعالات اسنیپ ها ارائه شده است. الگوریتم جستوجوی هارمونی ((HS یک روش فراابتکاری نسبتاً جدید میباشد. این الگوریتم در حل مسأله کشف تعاملات اسنیپ ها، از مدل سازی فرایندی که یک آهنگ ساز برای زیباتر کردن یک قطعه موسیقی طی می کند، استفاده و تعاملات اسنیپ ها را شناسایی می کند. در این پژوهش با استفاده از بهبود روش تولید جمعیت الگوریتم جستوجوی هارمونی در مسأله ذکر شده، رویکرد جدیدی برای یافتن اسنیپ های مرتبط ارائه شده است. نتایج برای داده های مصنوعی و واقعی نشان می دهد که قدرت این الگوریتم در تشخیص تعاملات جفت اسنیپ های مرتبط افزایش می یابد.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
جاسازی شبکههای مجازی با استفاده از روش بهینه سازی آموزش و یادگیری
محمدامین ناظم - قاسم میرجلیلی - علیمحمد لطیف
بهینهسازی چند هدفه رفتار لرزه ای پل های جداسازی شده تحت اثر زلزلههای حوزه نزدیک با کمک الگوریتم ژنتیک
میثم عفتی - علی خداکریمی - سید محمدرضا حسینی
Tsallis Entropy for Deep Transfer Learning and Domain Adaptation
Zahra Ramezani - Ahmad Pourdarvish
فیلتر پایین گذر Gm-C مرتبه-ششم توان پایین قابل استفاده در کاربردهای صوتی
محسن قائم مقامی - شهباز ریحانی
برخی از مسایل پیش روی سیستمهای خاکستری در محاسبات نرم
داود درویشی سلوکلایی - فرید پورافقی
مدلسازی ریاضی برای برنامهریزی اتاق عمل تحت شرایط عدم قطعیت فازی
فائزه عباسی - سید میثم موسوی - علیرضا بهاری
خوشهبندی خودکار دادهها با استفاده از جستجوی محلی و الگوریتم بهینهسازی تبادل حرارتی
مهسا شریفی - مهدی هاشم زاده - شهین پوربهرامی
حداکثر نرخ بازده سرمایه تحت متوسط ارزش در معرض ریسک فازی
زهرا کشاورزی - بیژن دواز
A bio-inspired optimization algorithm for estimating the reservoir capacity of dams
Hojjat Emami - Somayeh Emami
پروتکل وایرگارد ،نسل جدید شبکه های خصوصی مجازی با تکیه بر امنیت و سرعت
محمد عبیری - سید عبدالرضا حسام محسنی - مجید مشکین مژه
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.0.2